在接受记者采访时，何祚庥表示，东方思维对现代中国科技的发展没有什么大影响。古代中国的哲学思想如“五行论”等与中国现代科技的发展更是不着边际。真实的情况是，中国近代科学是从西方传入的，中国现代科技发展是在西方科技的基础上发展起来的。

　　对于东方思维是“整体论”一说，何祚庥也持异议，他倒认为东方思维是“笼统论”。“虽然中国古代既有唯心论也有唯物论，但中国的唯物论太笼统”。何祚庥认为，甚至连中国古代著名的唯物论著作《论衡》也存在着不少谬误。

　　《东方科学文化的复兴》认为“气一元论”是中国传统科学的思想核心，而何祚庥则认为，这恰恰说明古代中国没有科学思想。

　　“我研究过元气学说，写了两本相关学术专著。试问在‘气一元论’的指导下有什么科学成就没有？如果没有任何事例，说它是传统科学的核心思想就是没有道理的。”何祚庥说。

　　在接受记者采访时，著名科学家吴文俊也对一些人认为“五行论”等带有玄学色彩的思想代表了中国古代东方科学思想的说法，表达了自己的观点。

　　吴文俊认为这种说法非常荒唐，“阴阳五行没有科学的影子，连‘伪科学’都谈不上，简直是反科学。中国的阴阳五行说是阻碍中国发展的一个重要因素，我对此非常反感”。

　　对于曾轰动一时的《易经》是否阻碍了中国科学发展的大讨论，吴文俊认为不能因为书中一些虚无缥缈的理论，就过高地吹捧《易经》。

　　“当然书中也有些具体的东西，例如很多人推崇备至的‘河图’、‘洛书’，它们本身可以说是在学术上比较有意思的一项成果，但也就仅此而已，不能夸大。玄学是迷信的，根本谈不上‘学’。”