从本体论议之，《参同契》则突出了乾坤体性（即易简）表现为“自然”而无人为的情态。73章称：
物无阴阳，违天背元。牝鸡自卵，其刍不全，夫何故乎？配合不连，三五不交，刚柔离分，施化之精，天地自然。犹火动而炎上，水流而润下，非有师导使其然也。
阴阳、动静、刚柔、进退、屈伸、雌雄等两两相对，相反相成的乾坤体性，本是“道”化生天地万物而自然禀有了的体性，故天地的生机自然也是勃发的。如果“违天背元”（即违背宇宙运动变化的法则），就是违反道创生宇宙（施化）的自然体性（牝鸡自卵）。魏伯阳的所谓道之自然，不仅指道化生万物是自然而然的（无为），而且指万物禀有道之性是自然而然。这无疑符合老子的“道法自然”大义，也甚契“易则易知，简则易从”的《易》理。魏氏已深入地涉及了事物运动变化、发展的源泉和动力的问题。其对乾坤体性的把握，已暗含着天地万物是自我运动的，天地万物的变化发展只能从其自身去寻找的矛盾观。正是由于《参同契》对于“大易”的“自然”体性的强调，故郝敬会说：“《周易参同契》作自魏伯阳，大旨宗老氏。《道德经》者，老子之《易》也。门户毂轴，囊龠探赜，不一而足。有无玄妙，悉本其中。故知此书宗老氏。于易，则《参同契》云尔。”[12]另者，魏氏强调“易简”的自然体性，也意在说明炼丹应遵循“自然之所为”即为无为的实践原则，用药时须遵循“以类辅自然”的原则。如83章曰：
自然之所为兮，非有邪伪道；山泽气相蒸兮，兴云而为雨；泥竭遂成尘兮，火灭化为土；若蘖染为黄兮，似蓝成绿组；皮革煮为胶兮，麸蘗化为酒；同类易施功兮，非种难为巧。